一、低温冷害：密山地区作物生长季所需热量主要在5至9月之间，这段时间月平均气温总和不可小于83.2℃，如果出现低温现象，农作物就会受到冷害而减产。 

二、旱灾：密山曾多次出现春旱、夏旱、秋旱。春夏降水少，气温回升快，空气干燥，加上春风大，土壤水份蒸发迅速，影响旱田播种，有时旱到6月中下旬，造成水田缺水，大田作物的禾苗“卡脖旱”，旱情严重，造成减产。出现旱灾的年份有1989年、1998年、1999年、2000年、2001年、2004年、2005年。 

三、涝灾：密山降雨多集中在夏季，暴雨强度大，降雨日数多，土壤粘重，河道狭小，排水不良，酿成涝灾。较大的涝灾年份有1989年、1991年、1994年、2002年，2005年。 

四、风灾：密山有两条风道，一是穆棱河河谷风道，从二人班进入密山，经太平乡沿穆棱河谷向密山镇、扬木乡、八五七农场以东吹去，这股风，多由春、夏两季的西南大风形成。二是低山丘陵山谷风道从八五五农场入境，经富源乡、青年水库、密山镇一直向南，这股风道是处于低山丘陵山谷地形形成“喇叭口”式，风从口中刮入，越刮越大，因此，密山地区冬季北风增多。由于这两股风的综合影响，致密山镇、杨木乡、八五七农场一带风速偏大，大风次数较多。7级以上大风经常出现，每年都造成不同程度的风灾。 

五、霜冻：密山9月份农作物处于“灌浆”、乳熟期，寒潮袭来，出现霜冻，近地层气温骤然下降0℃以下，作物冻僵，籽粒空瘪。密山有“不怕春霜打，就怕秋霜冻”之谚。常年受霜冻危害的主要地区是西北部山区。1998年出现的霜冻，造成了严重的经济损失。 

六、冰雹：雹灾区，处于山前丘陵漫岗地区。“雹打一条线”，密山有3条冰雹线路，即北、中、南3路，中路最强烈，受灾最重的有八五五农场、富源乡、裴德镇、兴凯镇等地。1998年、1999年、2000年、2001年、2006年全市不同地区都曾受到冰雹的打击。 

七、病虫害：密山农作物病害主要有：稻瘟病、水稻潜叶蝇、负泥虫、大豆蚜虫、大豆食心虫、玉米螟、粘虫等，病虫害多发生于6至9月之间。