密山市属于温带针阔叶混交林区,也称为穆棱—三江平原植被区,植物种类有300多种。主要乔木树种有红松、云杉、赤松、樟子松、落叶松、柞树、椴树、水曲柳、黄菠萝、山杨、白桦、榆树、胡桃楸、唐槭、槐树、水冬瓜等。灌木有榛柴、胡枝子、杜鹃、丁香等上百种。藤本类有山葡萄、五味子等。此外还有龙胆草、刺五加等名贵中草药及蕨菜、薇菜等山野菜和榛蘑、元蘑等菌类,资源十分丰富。全市境内山区野生动物均有分布,现存野生动物20余种以上,主要有野猪、狍子、狐狸、鹿、野鸡、蛇等。